ISCC审核是对由法律认证机构或ISCC或由ISCC委托的人员执行的作为ISCC认证系统一部分的基于法律要求或自愿协议的现有可持续性要求的遵守情况的审查。认证机构进行的认证审核和/或重新认证审核之间应有区别，其目的是初次签发证书或合格声明和/或更新证书，认证机构或ISCC进行的监督审核。
ISCC有权在任何时候调整ISCC认证系统的系统标准，以确保或改善对证明ISCC认证系统的可持续性或完整性的法律法规或自愿承诺的要求。特别是，在法律法规，官方条件或命令发生变化或法院或当局对法律的解释发生变化的情况下，应有调整权。ISCC应通过电子邮件将系统标准的任何更改立即通知系统用户。
再生企业申请ISCC初次认证的审核核心标准：
1)审核对象是否在组织内部建立起满足ISCC标准要求的管理体系；
2)管理体系的职责分工是否明确，人员能力，尤其是ISCC相关的能力是否满足要求；
3)管理体系的运行是否充分有效，是否能保证企业关于可持续产品的声明是有效的；
4)ISCC相关文件的填写、维护、归档是否满足要求。
如果企业在证书有效期内的实际业务操作中，不按照管理体系文件和相关表单的要求严格执行，会面临证书被暂停和吊销的风险，也会给下一周期的认证留下隐患。所以被认证企业拿到证书以后，一定要严格按照制定的管理体系文件进行业务操作。
具体到实际操作，收集点须管理好原始收集点和服务商，并通过一套数据管理系统将原始收集点、原料类型、产量进行监控。如果温室气体排放量计算采用实际计算值，还需纳入运输距离、储存耗能等相关数据。
再生原料产品申请ISCC认证注意事项如下：
1、除了根据条款3.1缔结的系统使用协议之外，这些使用条款还应规范系统用户对ISCC认证系统的使用以及双方的权利和义务。
2、服务和ISCC网站的使用仅受以下使用条款和ISCC费用和关税的当前适用版本，徽标使用指南，ISCC认证系统的系统标准和ISCC完整性计划的约束..如果使用徽标使用指南和ISCC完整性计划，则当前适用的版本应为在认证（首次认证或续签）审核开始（审核的第一天）时在ISCC网站上发布的版本。证书）。费用和关税以及系统标准的当前适用版本应受以下规定约束。