贸易安全是AEO认证标准中的最后一个模块，其中涵盖场所安全、进入安全、人员安全、商业伙伴安全、货物物品安全、集装箱安全、运输工具安全、危机管理、安全培训九项内容。贸易安全主要围绕货物安全展开，包括人的安全与货物安全。
仓库区域作为企业最重要的存储区域，其安全隔离措施以及配套的安全管理是保障企业货物安全的核心，仓储区应当做到：分区的隔离措施和标志、非经授权人员禁止随意进入、必要的安全门禁措施、主要通道出入口登记等。
AEO认证仓库审核项目如下：
一、仓库来访登记
二、指定车位
三、做好货台隔离
四、门禁钥匙管理
五、高清监控和充足照明
六、货物分类存放
七、定期检查维护
（1）接收和装运货物：运抵的货物要与货物单证信息相符，核实货物的重量、标签、件数或者箱数。离岸的货物要与购货订单或者装运订单上的内容进行核实。企业对货物的接收和装运职责清晰，制度明确；在货物关键交接关节要有签名、盖章等保护制度。
（2）货物差异：在出现货物溢、短装或者其他异常现象（如火灾、水患等）时，李宏轩建议企业要及时报告或者采取其他应对措施，并有书面制度和程序。尤其是装运海关保税货物发现异常时，要向海关和其他有关部门报告相关内容和记录。